以危害新疆各族人民健康的民族高发性疾病（高发性肿瘤、代谢综合征等）、感染性疾病（包虫病、结核病等）和人畜共患病等为主要研究对象，以应用基础研究为实验室定位，并适当由基础研究向应用研究延伸；通过对新疆民族高发性疾病、感染性疾病和人畜共患病的流行病学、分子遗传学和分子生物学研究，在分子水平认识这些疾病的发病相关因素、分子发生机制，探讨其早期诊治适宜技术与有效的防治对策, 为新疆民族高发病、感染性疾病和人畜共患病的预防、诊断和治疗提供坚实的基础与防治策略。